Система управления факультетом соответствует уставным требованиям. Факультет возглавляет доктор медицинских наук профессор И.Л. Бровкина. Избрана на должность декана в 2006 году. Заместитель декана – к.м.н. Богомазов А.Д.

Выпускающей кафедрой факультета является кафедра педиатрии, которую возглавляет профессор, доктор медицинских наук И.Г. Хмелевская. Большинство дисциплин специального блока преподаются сотрудниками этой кафедры. Курс детской хирургии открыт при кафедре хирургических болезней №2 (зав. кафедрой - профессор доктор медицинских наук П.М.Назаренко). Руководит курсом доцент, кандидат медицинских наук С. В.Костин. Деканат и выпускающая кафедра тесно сотрудничают со всеми кафедрами, которые ведут подготовку на факультете. Учитывая многофакультетный, многопрофильный характер нашего вуза, совместная работа с кафедрамипреподающими на других факультетах позволяет обеспечить высокий уровень подготовки студентов, использовать творческий потенциал всего профессорско-преподавательского состава вуза. Выпускающие кафедры руководствуются в своей деятельности внутривузовским положением "О выпускающей кафедре". Данное положение четко определяет как права, так и обязанности коллективов кафедр, их заведующих, а также руководства вуза по материальному, методическому, кадровому обеспечению деятельности выпускающих кафедр. В положении оговорены полномочия всех субъектов управления на факультете: ректорат, Ученый совет медицинских специальностей, деканат, выпускающие кафедры.

В целом коллектив факультета успешно выполняет программу по обеспечению систематической и полноценной работы студентов, всех ее направлений: аудиторная, элективы, внеаудиторная (самостоятельная) работа, организация самоподготовки студентов и т.д. При этом приоритет отдается творческому поиску педагогов, которые находят поддержку со стороны ректората и деканата. Сотрудники факультета ежегодно выступают с докладами на научно-методических конференциях университета, публикуют материалы в сборниках других вузов страны.

Повышение педагогического и научного потенциала сотрудников факультета - это постоянная забота и ректората, и деканата факультета. Вузом организуются как выездные циклы усовершенствования, так и циклы на базе факультета повышения квалификации Университета. Циклы усовершенствования посвящены как отдельным вопросам организации учебного процесса (организация тестирования, проверки практических навыков, проблемному обучению и т.д.), так и внедрению инновационных методов в учебный процесс (использование мультимедиа в учебном процессе, организация компьютерных деловых игр, создание обучающих компьютерных программ).

Наличие в университете факультета дополнительного образования позволяет студентам факультета не только получить дополнительные специальности, но и организовать досуг.Студенты очного отделения факультета ежегодно занимаются в различных спортивных секциях и творческих кружках. Организованы команды факультета по игре "Что? Где? Когда?", команда КВН, которые неоднократно становились победителями и призерами внутривузовскихи всероссийских конкурсов.

Профессорско-преподавательский состав факультета ведет научную работу в составе 3 научных проблемных комиссий совместно с кафедрами других факультетов. Только за последние 5 лет сотрудниками факультета защищено 7 докторских и более 20 кандидатских диссертаций. Постоянно в центре внимания и Совета факультета, и деканата, и кафедр находится организация научной работы студентов. Большую помощь нам оказывает как научная часть университета, так и студенческое научное общество.

Руководство факультета большое внимание уделяет вовлечению студентов в управление деятельностью факультетов. Этому способствует регулярное проведение старостатов, встреч со студентами. Студенческий актив участвует в работе стипендиальных комиссий, пожелания студентов учитываются при составлении учебного расписания, выборе элективных курсов. Деканат всецело поддерживает развитие студенческого самоуправления в общежитиях, творческую, научную активность студентов, занятия спортом. Налажено тесное взаимодействие деканата и профкома студентов Университета. Совместно со студенческим активом решаются вопросы материальной поддержки малообеспеченных студентов, поощрения лучших студентов, заселение в общежитие, поддержка студенческих семей.

Руководством вуза в целом и факультета в частности, принимаются активные меры по внедрению вычислительной техники, ЭВМ, локальных сетей, Интернет во все сферы деятельности вуза, в том числе и в управление. Деканат факультета соединен с единой локальной сетью. При взаимодействии с кафедрами расширяется использование электронных носителей, электронной почты. В Интернете на сайте Университета есть информация о факультете, которая регулярно дополняется и обновляется. Все кафедры факультета оснащены компьютерной техникой и соответствующим современным программным обеспечением.