История библиотеки неразрывно связана с историей университета. Основанная в 1935 году одновременно с институтом библиотека в полной мере разделила его судьбу. Первой заведующей библиотекой была Михеева Анна Ивановна. Значительную помощь в комплектовании библиотечного фонда оказали областной библиотечный коллектор, медицинское училище и другие учреждения. Вместе с институтом в годы Отечественной войны библиотека была эвакуирована в г. Алма-Ату. За годы эвакуации большая часть книг пропала или перешла в негодность, и фонд учебной и научной литературы пришлось создавать почти заново.
К счастью, кроме небольшого числа книг, прибывших из Алма-Аты, в одном из зданий г. Курска сохранилась некоторая учебная литература. Кроме того, медицинскую литературу институт получил из Центральной медицинской библиотеки, а также Ивановского, Ижевского и Казанского медицинских институтов. К началу учебного года библиотека имела книжный фонд в количестве 21 тыс. книг, из них учебного фонда – около 8 тыс.